بسم الله الرحمن الرحيم
(Fatwa: 878/801/SN=7/1438)
When the Shafi’i Imam starts reading Qunoot after standing from the ruku you should not read the Qunoot rather stay silent. Further when the imam goes in ruku then you too should go in the ruku. Thus your salah shall be valid without any karahat.
ويتبع الموتم قانت الوتر لا الفجر … أي لا يتبع الموتم ألإمام القانت في صلاة الفجر وهذا عند أبى حنيفة ومحمد … وقال في الهداية : والأظهر وقوفه ساكتاً وصححه قاضيخان وغيره الخ (البحر الرائق 2/76، ط: زكريا)
Allah knows Best!
Darul Ifta,
Darul Uloom Deoband